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双向电泳结合质谱初步分析蛇岛蝮蛇毒蛋白质组

双向电泳结合质谱初步分析蛇岛蝮蛇毒蛋白质组

ISSN:0250-3263
2009年第44卷第4期
技术与方法
马驰[1],刘淑清[2],宗军卫[1],袁章利[1],孙明忠[3],吴玉群[4],李建立[4],孙立新[4],郑庆印[5] MA Chi[1],LIU Shu-Qing[2],ZONG Jun-Wei[1],YUAN Zhang-Li[1],SUN Ming-Zhong[3],WU Yu-Qun[4],LI Jian-Li[4],SUN Li-Xin[4],ZHENG Qing-Yin[5]
  1. 大连医科大学临床医学系,大连,116044
  2. 大连医科大学生化与分子生物学教研室,大连,116044
  3. 大连医科大学基础医学院生物技术系,大连,116044
  4. 辽宁蛇岛老铁山自然保护区管理处,大连,116041
  5. 凯斯西保留地大学医学院,克利夫兰,44106,美国

采用荧光染料(Cy5)标记中国辽宁蛇岛蝮(Gloydius shedaoensis shedaoensis,GSS)蛇毒(snake venom,SV,GSS-SV)蛋白质,获得了该蛇毒的双向十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(2D SDS-PAGE)图谱,经DeCyder软件分析,分辨出1000多个蛋白点,分子量范围在10~150ku间,等电点在4~7的蛋白质点占78.8%。凝胶后染色(post-staining)采用蛋白荧光染料Deep Purple,选取的5个蛋白点经胶内酶解,产生的肽段经高效液相色谱-电喷雾串联质谱(high performance liquid chromatography/HPLC-electro-spray ionization tandem mass spectrometry/ESI-MS/MS,HPLC-ESI-MS/MS)进行序列测定,质谱数据经Sequest Bioworks软件分析,为蛇毒L-氨基酸氧化酶、金属蛋白酶、类凝血酶、纤溶酶原激活物和磷脂酶A2的同源蛋白。本研究采用的荧光标记2DSDS-PAGE结合HPLC-ESI-MS/MS的技术适于高通量研究蛇毒蛋白组成。

The protein components contained in the snake venom of Gloydius shedaoensis shedaoensis(GSS-SV) were labeled with the fluorescent dye of Cy5.Then,the two-dimensional sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis(2D SDS-PAGE) profile of GSS-SV proteome was obtained.Gel image analysis by DeCyder software resolved over 1 000 protein spots with the apparent molecular weights ranging between 10 and 150 ku on the gel.The protein spots with the pI ranging between 4 and 7 covered about 78.8% of the over...

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ISSN:0250-3263
2009年第44卷第4期
技术与方法

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